ChEBI（生物学的に興味のある化学種データベース）

ChEBI（Chemical Entities of Biological Interest）は、生物学的に重要な小分子化合物を対象とした化学データベースおよびオントロジーです。欧州分子生物学研究所（EMBL）の一部門である欧州バイオインフォマティクス研究所（EBI）によって運営・管理されています。

概要と目的

ChEBIは、Open Biomedical Ontologies（OBO）プロジェクトの一環として開発されました。ここで扱う「化学種」とは、構造的または同位体的に区別される原子、分子、イオン、イオン対、ラジカル、ラジカルイオン、錯体、配座異性体などを指します。生理活性を持つ化合物であれば、天然由来か合成物かを問わず収録されています。

なお、核酸やタンパク質、タンパク質分解によって生成されるペプチドなど、ゲノムによって直接コードされる高分子は、原則としてChEBIの収録対象外となっています。

命名と分類

ChEBIは、国際純正・応用化学連合（IUPAC）および国際生化学・分子生物学連合（IUBMB）の命名委員会が策定した標準的な名称、記号、分類体系を採用しています。これにより、化学情報の正確な記述と分類が保証されています。

アクセスと利用

データベース内のデータは無所有権の情報源に由来しており、誰でも無料でアクセス可能です。各データは出典と完全に紐づけられており、追跡可能性が確保されています。データはWebサービスやダウンロードを通じて利用できるほか、SPARQLエンドポイントを通じたアクセスも提供されています。